|
Toggle Spin Toggle Label Change Color Scheme Change Display type |
|
The predicted interface residues are (shown as residueID:chainID, separated by comma)
160:A, 161:A, 162:A, 173:A, 174:A, 175:A, 177:A, 178:A, 179:A, 181:A, 206:A, 208:A, 209:A, 214:A, 237:A, 239:A, 241:A, 242:A, 243:A, 244:A, 245:A
Prediction by meta-PPISP : metamethod for Protein-Protein Interaction Site Prediction
Column 1: AA (Amino Acid code)
Column 2: Ch (Chain ID)
Column 3: AA# (Amino Acid number)
Column 4-7: Prediction scores of cons-PPISP, PINUP, Promate, and meta-PPISP
Note: PINUP and Promate scores are scaled by 100
Column 8: Prediction of whether the residue is in an interface
(P = Positive; N = Negative; - = Burried and not predicted)
(Note: P corresponds to a score > 0.34 in 7th column; user may set a
different threshold for positive prediction.)
*************************************************************************
S A 94 0.032 0.000 0.386 0.134 N
S A 95 0.917 0.000 0.385 0.213 N
S A 96 0.920 0.120 0.398 0.177 N
V A 97 0.964 0.120 0.398 0.240 N
P A 98 0.974 0.120 0.377 0.228 N
S A 99 0.059 0.000 0.360 0.097 N
Q A 100 0.974 0.000 0.348 0.178 N
K A 101 0.141 0.000 0.366 0.160 N
T A 102 0.657 0.000 0.388 0.109 N
Y A 103 0.141 0.000 0.457 0.102 N
Q A 104 0.009 0.000 0.495 0.051 N
G A 105 0.014 0.000 0.515 0.089 N
S A 106 0.251 0.000 0.512 0.082 N
Y A 107 0.273 0.000 0.491 0.072 N
G A 108 0.005 0.000 0.545 0.061 N
F A 109 0.000 0.000 0.598 0.000 -
R A 110 0.004 0.000 0.508 0.065 N
L A 111 0.000 0.000 0.529 0.000 -
G A 112 0.007 0.000 0.623 0.083 N
F A 113 0.000 0.000 0.584 0.000 -
L A 114 0.003 0.000 0.591 0.071 N
H A 115 0.003 0.000 0.556 0.055 N
S A 116 0.003 0.000 0.504 0.075 N
G A 117 0.004 0.000 0.428 0.027 N
T A 118 0.023 0.000 0.331 0.019 N
A A 119 0.032 0.000 0.285 0.016 N
K A 120 0.003 0.000 0.327 0.033 N
S A 121 0.006 0.000 0.347 0.045 N
V A 122 0.011 0.000 0.398 0.053 N
T A 123 0.007 0.000 0.436 0.039 N
C A 124 0.000 0.000 0.525 0.000 -
T A 125 0.000 0.000 0.000 0.000 -
Y A 126 0.154 0.000 0.573 0.104 N
S A 127 0.000 0.000 0.394 0.000 -
P A 128 0.010 0.000 0.463 0.036 N
A A 129 0.026 0.000 0.392 0.040 N
L A 130 0.167 0.000 0.347 0.053 N
N A 131 0.041 0.000 0.420 0.116 N
K A 132 0.059 0.000 0.366 0.034 N
M A 133 0.000 0.000 0.502 0.000 -
F A 134 0.000 0.000 0.382 0.000 -
C A 135 0.000 0.000 0.000 0.000 -
Q A 136 0.101 0.000 0.408 0.077 N
L A 137 0.044 0.240 0.535 0.228 N
A A 138 0.026 0.240 0.461 0.227 N
K A 139 0.009 0.000 0.436 0.088 N
T A 140 0.010 0.000 0.423 0.036 N
C A 141 0.000 0.000 0.000 0.000 -
P A 142 0.053 0.000 0.519 0.066 N
V A 143 0.000 0.000 0.000 0.000 -
Q A 144 0.005 0.000 0.592 0.056 N
L A 145 0.000 0.000 0.587 0.000 -
W A 146 0.066 0.000 0.619 0.081 N
V A 147 0.070 0.000 0.589 0.082 N
D A 148 0.011 0.000 0.551 0.066 N
S A 149 0.043 0.000 0.506 0.058 N
T A 150 0.022 0.000 0.489 0.050 N
P A 151 0.137 0.000 0.486 0.084 N
P A 152 0.026 0.000 0.464 0.073 N
P A 153 0.011 0.000 0.446 0.044 N
G A 154 0.055 0.000 0.434 0.068 N
T A 155 0.000 0.000 0.475 0.000 -
R A 156 0.661 0.000 0.421 0.159 N
V A 157 0.000 0.000 0.516 0.000 -
R A 158 0.215 0.120 0.476 0.196 N
A A 159 0.000 0.000 0.000 0.000 -
M A 160 0.980 0.240 0.482 0.353 P
A A 161 0.890 0.120 0.569 0.341 P
I A 162 0.651 0.240 0.471 0.351 P
Y A 163 0.000 0.000 0.542 0.000 -
K A 164 0.171 0.000 0.386 0.074 N
Q A 165 0.008 0.000 0.457 0.055 N
S A 166 0.100 0.000 0.462 0.107 N
Q A 167 0.115 0.000 0.473 0.113 N
H A 168 0.087 0.000 0.490 0.134 N
M A 169 0.166 0.000 0.464 0.118 N
T A 170 0.388 0.120 0.478 0.205 N
E A 171 0.452 0.240 0.526 0.296 N
V A 172 0.059 0.490 0.553 0.286 N
V A 173 0.034 0.990 0.603 0.560 P
R A 174 0.260 0.740 0.558 0.469 P
R A 175 0.077 0.740 0.533 0.461 P
C A 176 0.000 0.000 0.595 0.000 -
P A 177 0.080 0.870 0.567 0.520 P
H A 178 0.007 0.870 0.618 0.419 P
H A 179 0.011 0.620 0.612 0.395 P
E A 180 0.006 0.240 0.470 0.252 N
R A 181 0.068 0.370 0.514 0.341 P
C A 182 0.010 0.370 0.568 0.311 N
S A 183 0.024 0.370 0.491 0.198 N
D A 184 0.003 0.370 0.426 0.189 N
S A 185 0.004 0.240 0.412 0.144 N
D A 186 0.004 0.120 0.420 0.121 N
G A 187 0.007 0.120 0.422 0.115 N
L A 188 0.181 0.120 0.432 0.171 N
A A 189 0.000 0.000 0.444 0.000 -
P A 190 0.010 0.490 0.468 0.266 N
P A 191 0.005 0.240 0.496 0.217 N
Q A 192 0.029 0.370 0.504 0.273 N
H A 193 0.000 0.370 0.560 0.000 -
L A 194 0.000 0.620 0.592 0.000 -
I A 195 0.000 0.000 0.595 0.000 -
R A 196 0.197 0.000 0.446 0.084 N
V A 197 0.000 0.000 0.451 0.000 -
E A 198 0.744 0.000 0.409 0.175 N
G A 199 0.093 0.000 0.440 0.156 N
N A 200 0.915 0.000 0.442 0.178 N
L A 201 0.883 0.000 0.439 0.204 N
R A 202 0.665 0.000 0.422 0.181 N
V A 203 0.780 0.000 0.443 0.182 N
E A 204 0.914 0.120 0.433 0.201 N
Y A 205 0.977 0.120 0.470 0.262 N
L A 206 0.985 0.120 0.506 0.342 P
D A 207 0.938 0.000 0.513 0.260 N
D A 208 0.945 0.240 0.505 0.390 P
R A 209 0.943 0.240 0.504 0.378 P
N A 210 0.594 0.120 0.492 0.289 N
T A 211 0.186 0.240 0.485 0.208 N
F A 212 0.193 0.240 0.507 0.281 N
R A 213 0.984 0.240 0.503 0.308 N
H A 214 0.314 0.370 0.540 0.390 P
S A 215 0.000 0.240 0.512 0.000 -
V A 216 0.000 0.000 0.480 0.000 -
V A 217 0.962 0.000 0.448 0.247 N
V A 218 0.000 0.000 0.479 0.000 -
P A 219 0.801 0.000 0.456 0.161 N
Y A 220 0.066 0.000 0.507 0.069 N
E A 221 0.182 0.000 0.478 0.165 N
P A 222 0.163 0.000 0.479 0.073 N
P A 223 0.011 0.000 0.505 0.073 N
E A 224 0.307 0.000 0.466 0.085 N
V A 225 0.150 0.000 0.433 0.068 N
G A 226 0.230 0.000 0.488 0.075 N
S A 227 0.224 0.000 0.522 0.084 N
D A 228 0.111 0.000 0.544 0.075 N
C A 229 0.000 0.000 0.582 0.000 -
T A 230 0.129 0.000 0.549 0.075 N
T A 231 0.009 0.000 0.503 0.041 N
I A 232 0.000 0.000 0.484 0.000 -
H A 233 0.020 0.000 0.441 0.059 N
Y A 234 0.000 0.000 0.503 0.000 -
N A 235 0.000 0.000 0.422 0.000 -
Y A 236 0.000 0.000 0.538 0.000 -
M A 237 0.262 0.620 0.573 0.351 P
C A 238 0.000 0.870 0.653 0.000 -
N A 239 0.591 0.620 0.655 0.427 P
S A 240 0.572 0.120 0.630 0.301 N
S A 241 0.655 0.490 0.639 0.444 P
C A 242 0.135 0.740 0.660 0.500 P
M A 243 0.615 0.870 0.613 0.532 P
G A 244 0.415 0.870 0.618 0.537 P
G A 245 0.339 0.870 0.642 0.619 P
M A 246 0.000 0.240 0.619 0.000 -
N A 247 0.144 0.370 0.562 0.339 N
R A 248 0.023 0.240 0.533 0.271 N
R A 249 0.225 0.370 0.515 0.270 N
P A 250 0.006 0.370 0.478 0.257 N
I A 251 0.000 0.000 0.478 0.000 -
L A 252 0.000 0.000 0.329 0.000 -
T A 253 0.000 0.000 0.000 0.000 -
I A 254 0.000 0.000 0.435 0.000 -
I A 255 0.000 0.000 0.000 0.000 -
T A 256 0.000 0.000 0.460 0.000 -
L A 257 0.000 0.000 0.000 0.000 -
E A 258 0.072 0.000 0.445 0.066 N
D A 259 0.018 0.000 0.419 0.073 N
S A 260 0.006 0.000 0.402 0.047 N
S A 261 0.018 0.000 0.404 0.068 N
G A 262 0.070 0.000 0.427 0.064 N
N A 263 0.030 0.000 0.423 0.052 N
L A 264 0.052 0.000 0.448 0.089 N
L A 265 0.000 0.000 0.496 0.000 -
G A 266 0.000 0.000 0.519 0.000 -
R A 267 0.077 0.000 0.352 0.122 N
N A 268 0.000 0.000 0.432 0.000 -
S A 269 0.878 0.000 0.346 0.164 N
F A 270 0.000 0.000 0.434 0.000 -
E A 271 0.000 0.000 0.393 0.000 -
V A 272 0.000 0.000 0.520 0.000 -
R A 273 0.008 0.000 0.481 0.131 N
V A 274 0.000 0.120 0.638 0.000 -
C A 275 0.196 0.240 0.529 0.228 N
A A 276 0.023 0.120 0.453 0.138 N
C A 277 0.013 0.000 0.435 0.069 N
P A 278 0.000 0.000 0.382 0.000 -
G A 279 0.000 0.000 0.343 0.000 -
R A 280 0.015 0.000 0.388 0.050 N
D A 281 0.004 0.000 0.435 0.067 N
R A 282 0.010 0.000 0.371 0.054 N
R A 283 0.003 0.000 0.301 0.025 N
T A 284 0.006 0.000 0.347 0.047 N
E A 285 0.004 0.000 0.347 0.032 N
E A 286 0.024 0.000 0.288 0.028 N
E A 287 0.004 0.000 0.265 0.028 N
N A 288 0.004 0.000 0.275 0.022 N
L A 289 0.007 0.000 0.262 0.036 N
R A 290 0.055 0.000 0.258 0.033 N
K A 291 0.005 0.000 0.278 0.026 N
K A 292 0.004 0.000 0.266 0.020 N
G A 293 0.008 0.000 0.310 0.044 N
E A 294 0.004 0.000 0.360 0.039 N
P A 295 0.005 0.000 0.392 0.062 N
H A 296 0.023 0.000 0.406 0.058 N
H A 297 0.005 0.000 0.437 0.069 N
*************************************************************************
A pdb file in which meta-PPSIP prediction scores are stored as B-factors
can be downloaded at
http://pipe.sc.fsu.edu/meta-ppisp/out/0000f1b8df12202314a2394203ff3586/100000004/100000004.pdb
*************************************************************************
If there is no prediction printed above this asterisks line, you should
go back and check your submission input. The structure must be in
PDB format and chain IDs of protein must be entered.
This is an automated email, please do not reply.
Please contact pi2pe.fsu@gmail.com if you have questions or suggestions.
http://pipe.sc.fsu.edu
Powered by Jmol: an open-source Java viewer for chemical structures in 3D. http://www.jmol.org/